FRET 现象
荧光描述的是分子或原子在通过光的吸收激发电子系统后,自发发射光子的过程。发射的光子通常能量较低,因此波长较长(斯托克斯位移)。例如,蓝光激发可能导致绿色发射。如果第二个荧光分子能够吸收绿色光子,则该分子的发射再次发生斯托克斯位移,例如变为红色。这种再吸收在浓密样品中会导致测量误差(部分“内滤”效应)。在低浓度样品中,再吸收非常罕见。
如果两个分子在空间上非常接近(几纳米),能量可以直接从“供体”传递到“受体”,无需光的发生。这种能量直接交换称为“福斯特共振能量转移”(FRET)。“共振”表示两个分子必须共享能量窗口,即供体的发射光谱和受体的吸收光谱。尽管光子既不发射也不重新吸收,但能量传递仍然成立。FRET 的概率随着两个光谱的重叠面积增加而增加——窗口越匹配,传递的能量越多。此外,分子的取向也会影响转移效率。
对于上述示例,当样品被蓝光照射时,通常会收集到绿色发射。如果发生 FRET,还会发出红色光子,相应地减少绿色光子的数量。在极端情况下,所有能量完全转移,不会有绿色发射。FRET 效率由吸收的蓝色光子数量除以发出的红色光子数量定义,取值范围为 0 到 1。对于给定的 FRET 对,FRET 效率指示两个荧光物种之间的空间距离——这就是 FRET 测量的目标 [2]。
由于FRET需要荧光染料之间的距离非常短,因此它是验证细胞成分相互作用的工具。尽管通过测量纯粹的距离无法证明生物相互作用,但FRET将共定位精度提高到几纳米。二聚化过程和蛋白质的构象变化也是该方法的目标[3]。FRET生物传感器提供了一种间接应用,它们在与感知目标相互作用时改变其FRET效率。一个非常显著的例子是用于探测 Ca2+浓度变化的 Cameleon 生物传感器 [4]。
Förster Radius and FRET pairs
Förster 半径 R0 是一对荧光染料之间的距离,在这个距离下,FRET 效率达到 ½(即 50%)。通常,这个距离在 20 至 60 Å(2 至 6 nm)范围内。Förster 半径 R0 依赖于 FRET 对的光物理参数 [5]:
与
R0: Förster 半径
r: 供体-受体距离
如果已知给定 FRET 对的 Förster 半径,测量的 FRET 效率即可揭示两个荧光染料之间的距离 r。由于效率与距离的依赖关系中涉及到 6 次方,因此测量非常关键。反过来,所有距离的计算都不应被夸大。然而,测量活体样本中 FRET 效率的变化可以揭示交互性、运输现象和其他细胞事件的直接指示。
在活细胞中,常用染料是 GFP 变体,而在固定样本中,使用的染料范围从抗体标记染料到 GFP 变体或两者的组合。图 2 显示了一些常用的 FRET 对。随着新染料和荧光蛋白数量的增加,这个领域变得越来越丰富。具有相似光谱特性的染料是可以互换的,所有类型的排列组合都是可能的。
测量 FRET 效率的方法
测量 FRET 效应的最直接方法是 FRET-AP 方法。这里,样本被成像以显示供体。在之前的例子中,这指的是使用蓝色激发并收集绿色发射的实验。收集图像后,感兴趣区域被强烈照明,使用可以光漂白受体的光(因此称为“AP”,受体光漂白),但不会损坏供体。然后,拍摄供体的第二张图像。如果存在 FRET,供体在漂白区域的强度应增加,因为有更多的分子准备进行供体荧光,而不是流入 FRET 通道。FRET 效率 E 通过以下公式估算:
其中
• DA: 漂白前的供体强度
• DΩ: 漂白后的供体强度
AP 方法仅限于固定样本,因为图像是串行拍摄的。这需要时间,而活样本会在结构上发生变化或移动。一个改善活样本实验结果的方法称为 FRET-SE,意为“敏化”发射。敏化是指受体分子在供体激发后开始发射的事实,只要 FRET 成为可能。在此方法中,所有荧光通道同时收集。基于先前收集的修正因子,FRET 图像是从不同的平行图像计算得出的。尽管此方法能够检查活样本,但修正容易出错,获得可靠结果需要非常细致的实验 [1, 5]。
除了测量强度变化,荧光寿命的测量也可以揭示 FRET 的发生。供体的激发态通过发射一个光子回到基态而衰减。如果没有发生 FRET,荧光寿命描述了这些单路径衰减动力学。如果激发态也可以衰减到 FRET 通道,寿命会缩短——因为有第二种选择加速了激发态的清除。测量改变的寿命并提取动力学贡献也可以估算 FRET 效率。这种方法被称为 “FLIM-FRET” [6]。
图 3:FRET 受体光漂白示例。左图为光漂白前的供体图像。
中间的图像显示的是在一小块矩形区域内受体光漂白后的同一区域。在该区域,由于所有激发的分子只能通过发射荧光光子来衰减,因此供体的发射增加了。周围区域较暗的荧光表示荧光 “泄漏 “到 FRET 通道中。
右侧的假彩色图像是根据 FRET 效率公式计算得出的。矩形区域的荧光强度较高,说明该区域在漂白前的 FRET 效率较高。背景不包含任何 FRET 效率信息。
参考文献
- Lippincott-Schwartz J, Snapp E and Kenworthy AK: Studying protein dynamics in living cells. Molecular Cell Biology 2 (2001) 444–56.
- Förster T: Intermolecular Energy Migration and Fluorescence. Ann Phys 2 (1948) 55–75.
- Gadella TWJ, van der Krogt GNM, Bisseling T: GFP-based FRET microscopy in living plant cells. Trends Plant Sci4:7 (1999) 287–91.
- Miyawaki et al.: PNAS 96 (1999) 2135.
- Bastiaens PI and Pepperkok R: Observing proteins in their natural habitat: the living cell. Trends Biochem Sci 25 (2000) 631–37.
- Zimmermann T. et al.: Spectral imaging and linear un-mixing enables improved FRET efficiency with a novel GFP2-YFP pair. FEBS letters 245–49 (2002).