数码显微镜摄像头和图像分析的基础技术术语定义

数字图像由单个像素的阵列组成。这些像素的颜色信息可保存成数字代码，每一种颜色作为一个不同的数值存储。

颜色查询表是一种索引工具，所保存的这些数值主要以 RGB色彩空间基础，常用于监视器的具象化表现。

针对具体应用来选择适当的颜色查询表取决于用户自己的判断和需求。但经验证明，特定颜色查询表对于某些特定应用尤为有效且实用。例如，CLUT“绿色”通常用于记录用Alexa 488、FITC或其他类似荧光染料标记的样本，这些荧光染料都在绿色光谱范围内发射。另一方面，CLUT“红色”则用于使用TRITC、Texas Red、Cy3或其他类似的荧光染料来进行染色的样本，可在红色光谱范围内发光。

“CMYK”是一份特殊的颜色查询表，主要处理CMYK色彩空间且通常用于印刷系统的色彩输出。

在每一种成像系统（如，显示器、打印输出等）当中，任何颜色描绘都基于单个基本颜色的组合。成像方法通过加色和减色混合来加以区分。例如，在黑色显示屏上必须发射某种类型的光才能产生既定颜色。在这种情况下，光的类型以红绿蓝（RGB）为基础。

如果全部三种颜色都照亮则会生成白色。如果这三种颜色都被关闭则会生成黑色。人眼及数码相机和显示器都适应了RGB模型。

另一方面，印刷机使用了减色混合，因为在类似纸张的材料表面上，光必须从白色基材（纸张）上反射。因此，印刷机需要计算必须添加哪种墨水才能与白色基板结合以产生给定颜色。在这种情况下，青色、品红和黄色（CMY）的组合（红、绿、蓝的互补色）是光谱中所有其他颜色的基础。在这个模型中，添加全部三种颜色会形成黑色，而缺少全部三种颜色则会变成白色。

注：实际中，黑色使用单独的印墨来进行印刷以避免彼此叠加使用太多的颜色并获得更加生动的黑色印染表现。有鉴于此，色彩空间又被称为CMYK，其中K代表轮廓版，这是一种特殊的黑色印刷设备。

在共焦显微镜技术当中允许激光束在既定时间内扫描特定区域（相当于图像的像素尺寸）。该时间就被称为保持时间。合理地说，延长保持时间有助于光漂白并对样本形成压力。

数字摄像头将光子数据转换成数字数据。该过程中来自传感器的电子会经过预放大器。增益就是对图像传感器的信号实施放大处理。应当注意到，放大处理不仅会增强信号，同时也会让噪声一并增强。

人眼对光线的感知是非线性的。我们的眼睛无法感知到两个光子比单个光子的亮度高两倍；我们只能感知出两个光子比一个光子更亮一些。和人眼不同，数字摄像头对光的感知是线性的。两个光子的信号量就是一个光子的两倍。伽马值则可看作是人眼和数字摄像头之间的一种联系。

这可以用以下公式表示，其中Vout是输出（检测到的）亮度值，Vin是输入（实际）亮度值：

V_out = V_in^gamma

通过改变伽马值 – 即进行伽马校正处理 – 就可以借助线性记录相机拍摄的数字图像适应人眼的非线性感知。这种校正处理绝大多数摄像头芯片都可以实现。此外，数字成像软件通常也有自己的伽马校正选项。

噪声是所有测量中固有的不良特性。噪声是科学成像中关注的主要问题之一，毕竟噪声会影响到人们对感兴趣的信号进行量化的能力。成像时需要考虑的最重要参数是信噪比，即图像中的噪声与要采集的信号量的比值。噪声可分为以下几类：

光学噪声：通常由高背景染色引起的有害光信号，导致样本制备不良或样本高自发荧光。

暗噪声：电子在传感器中的热迁移，与积分长度成正比。暗噪声可以通过冷却成像传感器或缩短曝光时间来克服。

读取噪声：电荷从摄像头传感器内读出时引发的一种电噪声源。要减少读取噪声，可以减慢传感器读出速度，即减少最大可实现的帧速，或者换为更先进的传感器类型，即EMCCD和sCMOS传感器。

光子散粒噪声：由光子撞击传感器的随机性质引起的任何光信号中固有的噪声。这只在非常弱光的应用中被关注。采集更多的信号可以减少散粒噪声对图像的影响。

改善信噪比的最简单方法是通过延长积分计算时间或者增加照明强度来收集更多信号。这些方法并不总是可行，此时就需要使用更低噪声的摄像头。

摄像头中的像素是传感器的基本感光单元。这适用于所有二维阵列传感器，包括CCD、EMCCD、CMOS和sCMOS的显微镜摄像头。传感器上的像素数是一个经常被引用的单位，即500万像素的相机有500万像素。像素数量经常与传感器的分辨率混淆，因为不同传感器类型的单个像素的大小可能会有很大的差异。